В 1871 году был построен железнодорожный участок Осиновка — Минск — Брест Московско-Брестской железной дороги (с 1912 года — Александровская), и первый поезд по нему прошёл 28 ноября 1871 года. В результате строительных работ 1891—1892 годов железнодорожная магистраль стала двухпутной. Несмотря на это, железнодорожная станция в местечке Койданово появилась только в 1906 году, вместе с которой было возведено двухэтажное здание железнодорожного вокзала. Первым начальником станции стал А.Ф. Абрам. В 1909 году при железнодорожной станции проживали 15 жителей.

Во время Первой мировой войны с лета 1915 года город находился в прифронтовой зоне, а с весны 1916 года станцию неоднократно бомбили немецкие самолёты. В марте 1917 года в городе был образован Совет солдатских депутатов и большевистский комитет, а в ноябре этого же года установлена советская власть. В ноябре—декабре 1918 года город был оккупирован кайзеровскими войсками, после чего в город на непродолжительное время вернулись большевики. В июне 1919 года в ходе советско-польской войны город был оккупирован польскими войсками, которые сожгли город в июле 1920 года, в результате чего пострадало и здание вокзала.

29 июня 1932 года город Койданово был переименован в Дзержинск — в честь Ф.Э. Дзержинского. Несмотря на это, станция, расположенная в городе, сохранила своё первоначальное название.

В ходе Великой Отечественной войны станция с 28 июня 1941 года по 7 июля 1944 года находилась под контролем немецко-фашистских войск. С осени 1941 года до 1943 года гитлеровцы привозили на станцию эшелоны с евреями из оккупированных земель Западной Европы (Германии, Чехословакии и Польши). Сначала эти эшелоны прибывали в Минск, где часть евреев размещали в Минском гетто, а остальных сразу везли на станцию Койданово, откуда людей отправляли в урочище Рыжавка, где осуществлялись массовые убийства евреев. На территории Дзержинского района, на железнодорожных стПервым начальником станции стал А.Ф. Абрам. В 1909 году при железнодорожной станции проживали 15 жителей.

Во время Первой мировой войны с лета 1915 года город находился в прифронтовой зоне, а с весны 1916 года станцию неоднократно бомбили немецкие самолёты. В марте 1917 года в городе был образован Совет солдатских депутатов и большевистский комитет, а в ноябре этого же года установлена советская власть. В ноябре—декабре 1918 года город был оккупирован кайзеровскими войсками, после чего в город на непродолжительное время вернулись большевики. В июне 1919 года в ходе советско-польской войны город был оккупирован польскими войсками, которые сожгли город в июле 1920 года, в результате чего пострадало и здание вокзала.

29 июня 1932 года город Койданово был переименован в Дзержинск — в честь Ф.Э. Дзержинского. Несмотря на это, станция, расположенная в городе, сохранила своё первоначальное название.

В ходе Великой Отечественной войны станция с 28 июня 1941 года по 7 июля 1944 года находилась под контролем немецко-фашистских войск.
С осени 1941 года до 1943 года гитлеровцы привозили на станцию эшелоны с евреями из оккупированных земель Западной Европы (Германии, Чехословакии и Польши). Сначала эти эшелоны прибывали в Минск, где часть евреев размещали в Минском гетто, а остальных сразу везли на станцию Койданово, откуда людей отправляли в урочище Рыжавка, где осуществлялись массовые убийства евреев.
На территории Дзержинского района, на железнодорожных станциях Негарелое, Койданово и Фаниполь были созданы филиалы лагеря для советских военнопленных (шталаг—352),который был расположен в Масюковщине.
6 июля 1944 года Советская армия освободила город Дзержинск, а вместе с ним и станцию Койданово.